Традиционно грызуны разделяются на три подотряда: белкообразные, мышеобразные и дикобразообразные. Но в последнее время всё больше замечают, что систематика грызунов гораздо сложнее.
Подотряд белкообразные
семейство аплодонтиевые
семейство беличьи, в том числе белка и сурок
семейство соневидные
Подотряд боброобразные
семейство бобровые
семейство гоферовые
семейство мешотчатопрыгуновые
Подотряд дикобразообразные
надсемейство свинкообразные
семейство агутиевые
семейство водосвинковые
семейство пакарановые
семейство свинковые
надсемейство нутриеобразные
семейство восьмизубые
семейство колючешиншилловые
семейство хутиевые
семейство нутриевые
надсемейство шиншиллобразные
семейство шиншилловые
семейство крысиношиншилловые
семейство скальнокрысовые
семейство дикобразовые
семейство древеснодикобразовые
семейство землекоповые
семейство скальнокрысиные
семейство тростниковокрысиные
семейство гребнепалые
семейство гребнемышиные
подотряд шипохвостообразные
семейство долгоноговые
семейство шипохвостые
семейство тушканчиковые
семейство мышовковые
семейство мышиные
семейство колючесоневые
семейство слепышовые
семейство мышевиднохомячковые
семейство зайцегубохомячковые
семейство хомяковые